#1047(須々木氏)の書き込みを引用します:
＞access_logには、
＞"GET /~hogehoge/ HTTP/1.0" 200 123
＞error_logには、
＞premature EOF in parsed file /home/hogehoge/public_html/index.shtml
＞という記録がありました。

/home/hogehoge/public_html/.htaccess に
AddType text/x-server-parsed-html .shtml
という記述がありますか?
無ければ追加してみてください。