#1213(sai氏)の書き込みを引用します:
＞クッキーは正常に動作しています。

〜中略〜

＞以下はSSIからの呼び出しです。
＞http://sai.s1.xrea.com/cgi_html/count/c_conuter/index.shtml
＞
＞cgiを直接呼び出した場合は正常に動きます。
＞http://sai.s1.xrea.com/cgi_html/count/c_conuter/c_conuter.cgi

index.shtmlにカウンタを呼び出すタグを書いていると思いますが、どういう風に書いていますか？
それと、スクリプトの拡張子ですが、まさか*.cgiじゃないですよね？

＞ソースをTXTにしました。
ローカルサーバでは、たしかに動きました。
ただし、直接呼び出した場合ですが・・・