#1048(Rats氏)の書き込みを引用します:
＞/home/hogehoge/public_html/.htaccess に
＞AddType text/x-server-parsed-html .shtml
＞という記述がありますか?
＞無ければ追加してみてください。
再度ご報告いたします。

/home/hogehogeに.htaccessを置いておりました。理由は
/home/hogehoge/cgi-bin/にcount_g1.plが置いてあるからです。

試しに、/home/hogehoge/public_html/に.htaccessをmvしてみたところ
index.shtml自体の表示がapacheから拒否されてしまいました。

ということは、、設定が生きている反面なぜカウンターが表示されないのか、
謎？が深まったということでしょうか、、。